感兴趣的话题
- 食源性细菌群落组成及其在生产周期中的过渡阶段, 包装, 存储, 分配和消费不同的食物
- 绘制作物和动物农场食源性细菌群落的生物地理图谱
- 人类肠道微生物组及其变化对饮食制度的反应
- 包括肉毒梭菌在内的模式细菌的毒素产生和调控
- 快速可靠地鉴定食源性微生物，包括细菌, 病毒, 还有真核微生物
- 细菌对抗生素、杀菌剂、消毒剂、高温、低温和高压的耐药性
- 食源性细菌致病性的进化
过去、已完成、正在进行的研究项目
- 研究操纵处理时间可能产生的诱变效应, 频率, 脉冲光仪对单核增生李斯特菌基因组的能量和电压测定
- 评价全基因组测序(WGS)在最近沙门氏菌暴发中将污染种子与发芽联系起来的应用
- 超过100组I组和II组肉毒杆菌菌株的特征与毒素基因簇的重点
- 鉴定参与肉毒杆菌神经毒素产生调控的基因, 利用转录组学(RNA-seq)分析肉毒杆菌, 研究生长介质的作用, pH和温度
- 结合工业环境下生物膜的形成，研究微生物群落的组成和过渡阶段的特征
- 在不同的工业和实验室环境中，研究选择消毒剂对微生物群落结构和组成的影响
- 底特律城市社区花园土壤微生物群落特征与比较
- 开发一种准确、快速区分质粒与染色体序列的生物信息学工具
- 建立标记基因扩增子测序数据自动、一致分析的流水线
- 确定氨基酸变异和毒素类型多样性的热点
- 研究含有肉毒杆菌神经毒素基因的大质粒在几种梭菌中的命运
- 开发一个管道来简化和改进系统基因组分析
出版物
- 伊朗人，贝扎德，等等. 2022. 的力量, 潜在的, 好处, 以及在食品安全系统中实施高通量测序的挑战.npj食品科学.1 (2022): 35.
- 田,Renmao; Imanian Behzad. 2022. 质粒猎人:基于基因内容的准确快速质粒预测(正在审查中).
- 田,R. Imanian B. 2022. ASAP 2:一个管道和Web服务器来自动和一致地分析标记基因扩增子测序数据. 生物信息学杂志(23.
- 田,Renmao, Melissa Widel和Behzad Imanian. 2022. 肉毒杆菌神经毒素(BoNT)的轻链结构域，特别是受体结合结构域的c端是氨基酸变异和毒素类型多样性的热点. 基因13.10: 1915.
- 史密斯,T. J.田，R.*(共同第一作者)，伊朗人，B.威廉森，C. H.约翰逊，S. L.戴利高，H. E., & 希尔,K. M. 2021. 含Bont基因的全质粒与副肉毒梭菌染色体的整合, sporogenes梭状芽胞杆菌, 和阿根廷梭状芽孢杆菌. 毒物，13(7)，473.
工具
扩增子序列分析流水线(ASAP)
PlasmidHunter, PlasmidHunter
VBCG，即将推出